ইলিশ মাছের নামকরণে ১৯৭০ দশক পর্যন্ত কোন মতভেদ ছিলনা। সবাই এই রুপালী ইলিশকে Hilsa ilisha বলেই জানতেন। কিন্তু আশির দশকের দিকে শফি ও কুদ্দুস তাদের ‘বাংলাদেশের মাৎস্য সম্পদ (২০০১)’ পুস্তকে যখন এই ইলিশকে Hilsa ilisha না বলে Tenualosa ilisha বলে উল্লেখ করেন তখনই শুরু হয় এই বিভ্রান্তি। শফি ও কুদ্দুস তাদের বইয়ে এই মাছটিকে Tenualosa ilisha উল্লেখ করে এর বর্ণনা দিয়েছেন তবে ট্যাক্সোনমিক কি (Taxonomic key) ব্যবহার করে এর শনাক্তকরণের কোন পদ্ধতি বর্ণনা করেননি। মাছটির নামকরণে আরও বিভ্রান্তি ঘটে যখন হোয়াইটহেইড (Whitehead, 1985, FAO Fish Synop. (125) 7(1) 268) এই মাছটিকে Hilsa ilisha-র পরিবর্তে Tenualosa ilisha বলে বর্ণনা করেন। অর্থাৎ পদ্মা ইলিশের প্রজাতির নাম ilisha ঠিকই আছে কিন্তু গণ (genus) নাম এর পরিবর্তন ঘটিয়েছেন। এখন আমরা Hilsa ও Tenualosa এই দুটি গণ (genus) এর কোনটি গ্রহণযোগ্য তাই পর্যালোচনা করবো। এই স্বাদুপানির তথা নদীর ইলিশকে (freshwater/river shad) Cuvier ১৮২৯ সালে Clupea ilisha নামকরণ করেছিলেন (Regine animale, 2nd ed. 2, 320)। Day 1878 সালে এর নামকরণ করেছিলেন Clupea ilisha (Fishes of India, 640, PL 172 Fig 3, Fauna of British India, 1889, Fishes-1, 377)। ইতোপূর্বে Lacepede এর নামকরণ করেছিলেন Clupanodon ilisha (Hamilton-Buchanan, 1822, Fishes of the Ganges, 243, PL. 19, Fig. 73)